合肥微尺度物质科学国家实验室是科技部2003年11月批准筹建的五个国家实验室之一。实验室在长期坚持学科交叉与融合的基础上，通过对相关重点实验室资源的优化整合，逐步形成的一个以多学科综合为特点、以国家重大战略需求和交叉前沿领域为导向的新型实验室，其学科领域涉及物理、化学、材料、生物和信息，实现了五大一级学科之间大跨度的整合。实验室凝聚了一支以具备多学科背景的杰出人才为学科带头人、以优秀青年人才为主体的研究队伍和一支高水平的技术支撑队伍。110余位研究人员中，包括8位院士，11名长江学者特聘教授，31位国家杰出青年获得者，41位人才计划入选者，6个国家自然科学基金委创新研究群体和4个教育部创新团队。实验室是国家“量子调控”重大研究计划委托研究基地、国家首批 “海外高层次人才创新创业基地”、教育部“全国教育系统先进集体”和中国科学院“创新文化建设先进团队”。

　　实验室近年来在量子物理与通信、量子调控、单分子科学、高温超导材料、纳米科技等研究领域取得了一系列具有国际领先水平的创新进展。研究成果获国家自然科学二等奖4项、5次入选国际物理学十大（重大）进展、1次入选世界十大科技进展、连续8次入选中国两院院士评选的“中国十大科技进展”、4次入选“中国基础研究十大新闻”。